Polipeptid peptid zynjyrynyň dizaýny we çözgüdi

I. Gysgaça mazmun
Peptidler himiki we fiziki aýratynlyklarynda yzygiderliligi adaty bolmadyk makromolekulalardyr.Käbir peptidleri sintez etmek kyn, beýlekileri sintez etmek aňsat, ýöne arassalamak kyn.Amaly mesele, peptidleriň köpüsiniň suwly erginlerde birneme eremegidir, şonuň üçin arassalanmagymyzda gidrofob peptidiň degişli bölegi suw däl erginlerde eremeli, Şonuň üçin bu erginler ýa-da buferler ulanylyşyna düýbünden laýyk gelmeýän bolmagy ähtimal. biologiki tejribe proseduralary, tehniki işgärlere peptidi öz maksatlary üçin ulanmak düýbünden gadagan ediler, şonuň üçin aşakdakylar gözlegçiler üçin peptidleriň dizaýnynyň birnäçe tarapydyr.

Polipeptid peptid zynjyrynyň dizaýny we çözgüdi
Ikinjiden, sintetiki kyn peptidleri dogry saýlamak
1. Pes düzgünleşdirilen yzygiderliligiň umumy uzynlygy
15 galyndydan az bolan peptidleri almak has aňsat, sebäbi peptidiň ululygy ýokarlanýar we çig önümiň arassalygy azalýar.Peptid zynjyrynyň umumy uzynlygy 20 galyndydan köpelýändigi sebäpli önümiň takyk mukdary esasy aladadyr.Köp synaglarda galyndy sanyny 20-den aşak düşürip garaşylmadyk täsirleri almak aňsat.
2. Gidrofob galyndylarynyň sanyny azaltmak
Gidrofob galyndylarynyň aglaba köplügi bolan peptidler, esasanam sebitde C terminalyndan 7-12 galyndy, sintetiki kynçylyklary döredýär.Bu, ýeterlik däl kombinasiýa hökmünde görülýär, sebäbi sintezde B gatly kagyz alynýar."Şeýle ýagdaýlarda iki-den gowrak polo positiveitel we otrisatel galyndylary öwürmek ýa-da peptidiň düzümini açmak üçin Gly ýa-da Pro-ny peptide goýmak peýdaly bolup biler."
3. “Kyn” galyndylaryň düzgünleşdirilmegi
"Cys, Met, Arg we synap görüň, adatça sintez edilmeýän galyndylar bar."Ser, adatça Cys-a zäherlenmeýän alternatiwa hökmünde ulanylar.
Polipeptid peptid zynjyrynyň dizaýny we çözgüdi

Üçünjiden, suwda ereýän dogry saýlawy gowulandyryň
1. N ýa-da C terminalyny sazlaň
Kislotaly peptidler bilen deňeşdirilende (ýagny pH 7-de otrisatel zarýad berilýär), asetilasiýa (N-terminus asetilasiýa, C terminasy elmydama erkin karboksil toparyny saklaýar) otrisatel zarýady ýokarlandyrmak maslahat berilýär.Şeýle-de bolsa, esasy peptidler üçin (ýagny pH 7-de pololyitel zarýad berilýär) aminasiýa (N-terminusda erkin amin topary we C terminalynda aminasiýa) polo positiveitel zarýady ýokarlandyrmak aýratyn maslahat berilýär.

2. Yzygiderliligi gaty gysgaldyň ýa-da uzadyň

Käbir yzygiderlilikde Trp, Phe, Wal, Ile, Leu, Met, Tyr we Ala ýaly köp sanly gidrofob aminokislotalar bar, bu gidrofob galyndylary 50% -den geçende, adatça eremek aňsat däl.Peptidiň polo positiveitel we otrisatel polýuslaryny hasam köpeltmek üçin yzygiderliligi uzaltmak peýdaly bolup biler.Ikinji wariant, gidrofob galyndylaryny azaltmak arkaly polo positiveitel we otrisatel polýuslary köpeltmek üçin peptid zynjyrynyň ululygyny peseltmekdir.Peptid zynjyrynyň oňyn we otrisatel taraplary näçe güýçli bolsa, suw bilen reaksiýa şonça-da köp bolar.
3. Suwda erän galyndy goýuň
Käbir peptid zynjyrlary üçin käbir oňyn we otrisatel aminokislotalaryň birleşmegi suwuň erginini gowulaşdyryp biler.Kompaniýamyz, kislotaly peptidleriň N-terminusyny ýa-da C-terminini Glu-Glu bilen birleşdirmegi maslahat berýär.Esasy peptidiň N ýa-da C termini berildi, soňra Lys-Lys.Zarýad berlen topary ýerleşdirip bolmaýan bolsa, Ser-Gly-Ser hem N ýa-da C terminalynda ýerleşdirilip bilner.Şeýle-de bolsa, peptid zynjyrynyň taraplaryny üýtgedip bolmajak bolsa, bu çemeleşme işlemeýär.